Reporte Gráfico Consolidado: El siguiente panel interactivo muestra la visualización conjunta de los marcadores principales para el agrupamiento basal.
Archivo: markers_all_clusters_combined.pdf
¡Hola! Soy Geni, el asistente inteligente de GenoScribe. Estoy aquí para ayudarte a explorar de forma interactiva el contenido de este informe bioinformático.
Cuando me haces una pregunta, primero intento reconocer si coincide con alguno de los patrones o expresiones que conozco. Si encuentro una coincidencia, te responderé directamente con una respuesta predefinida, diseñada para ser rápida, clara e incluso un poco ingeniosa. Si no reconozco el patrón, entonces activo mis herramientas de búsqueda: genero representaciones vectoriales (embeddings) y busco los fragmentos más relevantes entre varios documentos —incluyendo el propio informe, archivos PDF y HTML externos, y sesiones de preguntas y respuestas (QA). A partir de esa información, creo un resumen que intenta ofrecerte una respuesta coherente y útil basada en el contenido existente.
Se debe tener en cuenta que este entorno es experimental. No utilizo grandes modelos de lenguaje, por lo que algunas respuestas pueden ser aproximadas o incompletas. El objetivo principal es facilitar una visualización rápida, comprensible y reproducible de la información contenida en los documentos, permitiendo una exploración más dinámica del informe.
Actualmente, los resultados pueden variar en precisión, ya que empleo modelos ligeros y locales para asegurar que la aplicación funcione en cualquier entorno sin necesidad de servidores externos. Sin embargo, la estructura del sistema está preparada para mejorar notablemente su rendimiento en el futuro mediante la integración con modelos más avanzados o APIs externas. Para comenzar, simplemente escribe tu pregunta en el campo inferior y deja que yo me encargue del resto. ¡Prometo poner todo mi código en ello!
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En esta pestaña se documenta la fase de Identificación de Marcadores para los clústeres primarios (no supervisados). Tras haber estructurado matemáticamente el conjunto de células en la etapa de clustering, el objetivo bioinformático de esta sección es interrogar el transcriptoma de estas agrupaciones numéricas para descubrir qué genes definen su identidad molecular única.
Para sentar las bases de este descubrimiento ciego, la sección inicial (4.1. Fundamentos del Análisis de Expresión Diferencial) detalla la lógica algorítmica y estadística empleada. El enfoque principal se basa en una estrategia de “Clúster X frente al resto” (Cluster vs All), la cual compara el perfil de expresión de cada clúster individual contra todas las demás células de la muestra de forma simultánea, extrayendo una firma génica ponderada por su magnitud de cambio (Log2 Fold Change) y significancia (p-value ajustado).
Al igual que en la etapa topológica previa, los resultados se exponen bajo las dos estrategias de agrupamiento principales (sujetas a la disponibilidad del proyecto): agrupamiento basal (Merged) y agrupamiento alineado (Integrated). El análisis de cada una de estas aproximaciones se ha estructurado en un flujo de trabajo de dos niveles de profundidad:
.tsv convertidos a formato dinámico e interactivo), permitiendo al investigador navegar por los datos crudos de forma aislada e independiente.
La exploración metódica de estas firmas génicas es el paso empírico y definitivo que permitirá, en el siguiente gran módulo del estudio, traducir las matemáticas a biología bautizando a cada clúster con su verdadero linaje celular.
Tabla de contenidos de esta sección
4. Identificación de Marcadores (Clústeres ciegos)
Habiendo completado la fase topológica documentada en el módulo anterior, disponemos de un mapa espacial donde las células se encuentran estructuradas en clústeres puramente numéricos (0, 1, 2…). Sin embargo, para la biología computacional, estos grupos matemáticos son entidades fenotípicamente “ciegas”. El verdadero poder del análisis de célula única reside en interrogar la matriz de expresión subyacente de cada uno de estos grupos para extraer su identidad molecular intrínseca.
Esta sección está diseñada para guiar al investigador a través de este proceso de descubrimiento de forma sistemática. Para garantizar una interpretación rigurosa de los resultados, el documento se ha estructurado siguiendo una progresión analítica lógica:
En cada una de estas aproximaciones descendemos desde una visión global (mapas de calor de todo el tejido) hasta el máximo nivel de detalle (inspección interactiva de clúster por clúster). No obstante, antes de sumergirnos en los extensos catálogos de genes candidatos, es indispensable comprender el motor algorítmico que los ha seleccionado, el cual se detalla de forma metodológica a continuación.
4.1. Fundamentos del Análisis de Expresión Diferencial
En transcriptómica de célula única, la identificación de genes marcadores se fundamenta en el Análisis de Expresión Génica Diferencial (DEG). Dado que en esta fase exploratoria los clústeres carecen de una identidad biológica predefinida y no se están comparando condiciones experimentales directas (ej. WT frente a KO), el algoritmo de Seurat ejecuta una aproximación de descubrimiento topológico conocida como “Clúster frente al resto” (Cluster vs All).
Esta estrategia iterativa aísla computacionalmente las células de un clúster de interés (por ejemplo, el Clúster 0) y confronta su perfil transcripcional simultáneamente contra el de todas las demás células de la muestra combinadas (los clústeres 1, 2, 3… en conjunto). El objetivo estadístico es identificar aquellos genes cuya expresión es excepcionalmente alta y exclusiva en el clúster evaluado.
Para ejecutar esta comparación masiva de forma rigurosa, se emplea habitualmente la prueba de suma de rangos de Wilcoxon (el estándar por defecto en la bioinformática de Single-Cell). Este test no paramétrico es idóneo para lidiar con las distribuciones asimétricas y la alta proporción de ceros técnicos (dropouts) inherentes a esta tecnología de secuenciación. Fruto de esta prueba matemática, se generan los archivos tabulares (.tsv) que se explorarán en los apartados posteriores. Cada fila de estas tablas corresponde a un gen candidato, descrito por las siguientes métricas fundamentales:
p_val) ⇒ El nivel de significancia estadística nominal devuelto directamente por el test matemático. Sin embargo, al testar miles de genes de forma simultánea, este valor por sí solo genera falsos positivos y no debe utilizarse como criterio principal.
avg_log2FC) ⇒ Cuantifica la magnitud del cambio en la expresión media del gen. Un valor positivo indica que el gen está sobreexpresado (upregulated) en el clúster analizado frente al resto. Cuanto mayor sea este logaritmo, más “fuerte” y discriminativo será el marcador.
pct.1) ⇒ Indica la fracción de células dentro del clúster de interés que expresan dicho gen (es decir, que cuentan con al menos 1 UMI detectado). Un marcador robusto debería tener un pct.1 elevado (idealmente superior a 0.50 o 50%), garantizando que es representativo de la mayoría de esa subpoblación.
pct.2) ⇒ Indica la fracción de células fuera del clúster de interés que también expresan el gen. Un marcador ideal y exclusivo mostrará un pct.2 muy bajo (cercano a 0), demostrando que apenas existe expresión residual en el resto del tejido.
p_val_adj) ⇒ Es la métrica de significancia definitiva, sometida a una estricta corrección por comparaciones múltiples (típicamente corrección de Bonferroni). Para que un gen se considere un biomarcador válido y biológicamente relevante, este valor debe ser estrictamente inferior a 0.05.
La correcta interpretación de estas tablas pasa por comprender la interacción de sus variables: el marcador biológico perfecto es aquel que combina un alto avg_log2FC, un alto pct.1, un bajísimo pct.2 y un p_val_adj significativo. Con estos fundamentos establecidos, las siguientes subsecciones despliegan este escrutinio empírico de forma individualizada para cada estrategia de agrupamiento.
4.2. Firmas génicas en agrupamiento basal (Merged)
Comenzamos la identificación fenotípica explorando la estrategia Merged. Dado que este agrupamiento preserva los niveles de expresión originales sin aplicar algoritmos de alineamiento o corrección de lote, las firmas génicas descubiertas aquí representan las diferencias moleculares de las células en su estado transcriptómico más puro. Constituye la aproximación de referencia siempre y cuando las condiciones experimentales no presenten sesgos técnicos limitantes.
A continuación, se presenta el directorio completo correspondiente a los marcadores extraídos de esta topología basal. Desde este explorador podrá descargar todos los archivos generados en esta fase, incluyendo posibles tablas maestras consolidadas (archivos .csv o .xlsx) con el compendio global de todos los marcadores hallados en el tejido.
Explorar directorio de Marcadores (Merged)
4.2.1. Visualización global de marcadores
Antes de diseccionar cada subpoblación celular de forma independiente, resulta inmensamente útil obtener una panorámica visual de la expresión en todo el tejido. En los casos en los que se haya generado, esta subsección mostrará un documento PDF consolidado. Este archivo actúa como un atlas resumen, agrupando en un único formato multipágina las proyecciones espaciales y de expresión (FeaturePlots, mapas de calor, etc.) de los marcadores más significativos correspondientes a todos los clústeres simultáneamente, facilitando su revisión general y compartición.
Reporte Gráfico Consolidado: El siguiente panel interactivo muestra la visualización conjunta de los marcadores principales para el agrupamiento basal.
Archivo: markers_all_clusters_combined.pdf
4.2.2. Escrutinio estadístico por clúster (Cluster vs All)
A continuación se despliega el núcleo analítico de la sección mediante el desglose individualizado de cada agrupación primaria. Para cada clúster evaluado matemáticamente, se proporciona un panel de resultados que documenta su perfil diferencial frente al resto de la población celular.
En aquellos casos en los que la estructura de directorios disponga de archivos individuales (típicamente designados con el sufijo _vs_all), se expondrá de forma iterativa:
avg_log2FC) y su significancia (p_val_adj).
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 0 en la estrategia Merged. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica frente al resto del tejido, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_0_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_0_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 0.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 1 en la estrategia Merged. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica frente al resto del tejido, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_1_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_1_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 1.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 2 en la estrategia Merged. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica frente al resto del tejido, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_2_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_2_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 2.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 3 en la estrategia Merged. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica frente al resto del tejido, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_3_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_3_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 3.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 4 en la estrategia Merged. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica frente al resto del tejido, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_4_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_4_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 4.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 5 en la estrategia Merged. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica frente al resto del tejido, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_5_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_5_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 5.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 6 en la estrategia Merged. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica frente al resto del tejido, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_6_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_6_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 6.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 7 en la estrategia Merged. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica frente al resto del tejido, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_7_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_7_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 7.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 8 en la estrategia Merged. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica frente al resto del tejido, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_8_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_8_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 8.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 9 en la estrategia Merged. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica frente al resto del tejido, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_9_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_9_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 9.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 10 en la estrategia Merged. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica frente al resto del tejido, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_10_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_10_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 10.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 11 en la estrategia Merged. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica frente al resto del tejido, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_11_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_11_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 11.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 12 en la estrategia Merged. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica frente al resto del tejido, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_12_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_12_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 12.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 13 en la estrategia Merged. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica frente al resto del tejido, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_13_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_13_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 13.
4.3. Firmas génicas en agrupamiento alineado (Integrated)
Tras analizar la topología basal, procedemos a explorar los marcadores derivados de la estrategia Integrated. En este escenario, la matriz ha sido sometida a algoritmos de anclaje matemático para corregir posibles efectos de lote (batch effects). Las firmas génicas que emergen en esta sección son especialmente robustas, ya que representan a genes conservados que definen un tipo celular superando las desviaciones técnicas o biológicas entre las distintas condiciones (ej. WT vs KO).
A continuación, se presenta el directorio completo correspondiente a los marcadores extraídos de esta topología alineada. Desde este explorador podrá descargar todos los archivos generados, incluyendo tablas maestras consolidadas (archivos .csv o .xlsx) con el compendio global de los biomarcadores.
Explorar directorio de Marcadores (Integrated)
4.3.1. Visualización global de marcadores
Al igual que en el caso anterior, en los proyectos que lo dispongan, esta subsección albergará un documento PDF consolidado. Este archivo agrupa en un único formato multipágina las visualizaciones espaciales de los marcadores top para todos los clústeres integrados simultáneamente, ofreciendo una panorámica esencial del tejido alineado antes de proceder a la disección individual.
Reporte Gráfico Consolidado: El siguiente panel interactivo muestra la visualización conjunta de los marcadores principales para el agrupamiento alineado.
Archivo: markers_all_clusters_combined.pdf
4.3.2. Escrutinio estadístico por clúster (Cluster vs All)
A continuación se despliega el núcleo analítico mediante el desglose individualizado de cada agrupación integrada. Para cada clúster evaluado se proporciona un panel que documenta su perfil diferencial frente al resto de la población celular corregida.
En aquellos casos en los que la estructura disponga de archivos individuales (típicamente designados con el sufijo _vs_all), se expondrá de forma iterativa:
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 0 en la estrategia Integrated. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica superando los posibles sesgos de origen, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_0_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster integrado.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_0_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 0.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 1 en la estrategia Integrated. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica superando los posibles sesgos de origen, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_1_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster integrado.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_1_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 1.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 2 en la estrategia Integrated. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica superando los posibles sesgos de origen, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_2_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster integrado.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_2_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 2.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 3 en la estrategia Integrated. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica superando los posibles sesgos de origen, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_3_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster integrado.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_3_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 3.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 4 en la estrategia Integrated. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica superando los posibles sesgos de origen, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_4_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster integrado.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_4_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 4.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 5 en la estrategia Integrated. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica superando los posibles sesgos de origen, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_5_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster integrado.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_5_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 5.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 6 en la estrategia Integrated. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica superando los posibles sesgos de origen, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_6_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster integrado.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_6_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 6.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 7 en la estrategia Integrated. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica superando los posibles sesgos de origen, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_7_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster integrado.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_7_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 7.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 8 en la estrategia Integrated. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica superando los posibles sesgos de origen, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_8_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster integrado.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_8_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 8.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 9 en la estrategia Integrated. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica superando los posibles sesgos de origen, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_9_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster integrado.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_9_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 9.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 10 en la estrategia Integrated. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica superando los posibles sesgos de origen, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_10_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster integrado.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_10_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 10.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 11 en la estrategia Integrated. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica superando los posibles sesgos de origen, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_11_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster integrado.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_11_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 11.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 12 en la estrategia Integrated. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica superando los posibles sesgos de origen, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_12_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster integrado.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_12_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 12.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 13 en la estrategia Integrated. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica superando los posibles sesgos de origen, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_13_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster integrado.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_13_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 13.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 14 en la estrategia Integrated. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica superando los posibles sesgos de origen, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_14_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster integrado.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_14_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 14.
En este apartado se desglosa el perfil de expresión diferencial específico del Clúster 15 en la estrategia Integrated. La revisión aislada de esta agrupación permite identificar inequívocamente su firma génica superando los posibles sesgos de origen, sentando las bases empíricas para su posterior anotación fenotípica.
Reporte Gráfico de Marcadores Top: markers_cluster_15_vs_all.pdf
El siguiente panel interactivo resume visualmente la localización espacial y el nivel de expresión de los genes más representativos de este clúster integrado.
Tabla Estadística Completa (DEG): markers_cluster_15_vs_all.tsv
Para complementar el análisis visual superior, esta tabla expone de forma directa e interactiva todos los estadísticos del contraste diferencial, ordenados por significancia biológica para el Clúster 15.
Habiendo extraído y catalogado exhaustivamente las firmas génicas de cada clúster —tanto en la topología basal como en la integrada— disponemos ahora del “carnet de identidad” molecular de cada subpoblación. Sin embargo, designaciones numéricas como “Clúster 0” o “Clúster 1” siguen siendo artefactos puramente matemáticos. El último eslabón imprescindible para dar un sentido biológico y funcional a este mapa topológico consiste en traducir estas listas de genes aislados a fenotipos celulares reales.
Este proceso de inferencia fenotípica se abordará en el proyecto mediante una estrategia analítica dual. En primer lugar, se ejecutará una anotación automática, empleando algoritmos que cruzan nuestras firmas génicas con bases de datos transcriptómicas de referencia (como Human Primary Cell Atlas, Monaco Immune Data o atlas genéricos murinos) para asignar linajes principales de forma rápida y no sesgada (ej. Células T, Monocitos, Estroma).
En segundo lugar, dado que la biología intrínseca del tejido a menudo presenta una resolución o unos estadios de maduración que escapan a las bases de datos genéricas, se realizará una anotación manual curada. Mediante la inspección experta de marcadores canónicos, se afinará la nomenclatura para definir subpoblaciones específicas y etapas concretas de desarrollo.
La asignación definitiva de estos linajes representa la cristalización del análisis de célula única, dotando de contexto biológico a todos los cálculos previos. Todo este proceso de etiquetado y validación celular se detalla en el siguiente módulo del informe: 5. Anotación celular (automática y manual).